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紫花苜蓿几丁质酶ClassⅠ基因cDNA全长克隆及序列分析

紫花苜蓿几丁质酶ClassⅠ基因cDNA全长克隆及序列分析

作     者:伊亚莉 关宁 张文娟 王涌鑫 苗丽宏 李聪 

作者机构:中国农业科学院畜牧兽医研究所牧草遗传育种研究室北京100193 

基  金:国家科技支撑计划(编号:2006BAD01A19) 农业部苜蓿种质资源保种专项 

出 版 物:《江苏农业科学》 (Jiangsu Agricultural Sciences)

年 卷 期:2011年第39卷第2期

页      码:29-34页

摘      要:依据NCBI中已登录的截形苜蓿(Medicago truncatula)几丁质酶基因的一段EST序列(GenBank登录号:AF167323)设计引物,以紫花苜蓿(Medicago sativaL.)为试验材料,利用RACE技术进行cDNA全长克隆。利用生物信息学软件对该序列进行分析得知:该基因全长1 132 bp,其中含有1个930 bp的开放阅读框,编码309个氨基酸。分子质量为33.538 ku,等电点pI为5.258,是一个酸性蛋白且分泌到胞外。将该基因命名为MsChiⅠ(GenBank登录号为HM224449)。聚类分析显示:它与其他已知植物ClassⅠ类几丁质酶基因具有高度的同源性;结构分析表明:该蛋白的二级结构中α螺旋、延伸链、β转角和无规则卷曲分别占25.89%、10.68%、4.21%、59.22%;功能分析可知:该蛋白为亲水性非跨膜蛋白,属于几丁质酶第19家族。

主 题 词:紫花苜蓿 几丁质酶基因 cDNA克隆 序列分析 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

D O I:10.3969/j.issn.1002-1302.2011.02.009

馆 藏 号:203187210...

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