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金针菇基因组SSR位点分析及标记开发

金针菇基因组SSR位点分析及标记开发

作     者:金群力 沈颖越 蔡为明 周烁红 范丽军 冯伟林 宋婷婷 李良英 田芳芳 

作者机构:浙江省农业科学院园艺研究所浙江杭州310021 浙江师范大学化学与生命科学学院浙江金华321004 

基  金:浙江省农业新品种选育重大科技专项-食用菌新品种选育(2012C12911) 国家自然科学基金项目(31401930)资助 

出 版 物:《食用菌学报》 (Acta Edulis Fungi)

年 卷 期:2016年第23卷第2期

页      码:12-19页

摘      要:以金针菇(Flammulina velutipes)基因组序列为基础,对其SSR位点进行分析,设计16对引物对其中16个SSR位点进行标记设计,并对6个商业化的金针菇品种进行筛选。统计结果表明,金针菇基因组有1279个位点,SSR位点密度为35.53/Mb,并以三核苷酸基序为主,重复数≥10的SSR(即高频)基序数目总计246个,占所有SSR位点的19.23%。设计的16对SSR标记均能扩增条带,多态率仅为18.75%。

主 题 词:金针菇基因组 SSR位点 多态性标记 

学科分类:09[农学] 0902[农学-自然保护与环境生态类] 090202[090202] 

核心收录:

D O I:10.16488/j.cnki.1005-9873.2016.02.003

馆 藏 号:203187682...

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