miR395abcd与其靶基因ATRX在不同耐寒木薯品种中对低温响应的差异性分析

作     者：曾长英 周玉飞 彭明 Zeng Changying;Zhou Yufei;Peng Ming

作者机构：中国热带农业科学院热带生物技术研究所海口571101 贵州省亚热带作物研究所兴义562400 

基　　金：国家国际科技合作专项(2013DFA32020) 海南省重大科技项目子课题(ZDZX2013023-1) 海南省自然科学基金(313075) 中央级公益性科研院所基本科研业务费(ITBB2015RC01)共同资助 

出 版 物：《基因组学与应用生物学》 (Genomics and Applied Biology)

年 卷 期：2015年第34卷第11期

页      码：2441-2447页

摘      要：通过实时定量PCR方法分析了mi R395abcd与其靶基因ATRX在两个木薯品种的4种低温处理下的差异表达情况,靶基因的定量引物设计在与mi RNA结合区的上游、结合边缘、结合区3个位置。结果显示mi R395abcd与其靶基因在两个木薯品种、4种低温处理和3个靶基因引物位置的表达量均不同,且mi R395abcd在C4和SC124两个品种间4种低温处理的6组两两比较中的相对表达量呈现完美的反向关系。进一步比较发现mi R395abcd与靶基因的负相关性在C4中最好,尤其是位于mi RNA与m RNA结合区上游的a引物的消长关系在AH(驯化后寒害:25~14℃驯化5 d后再降至4℃)和NAH(非驯化寒害:25℃直接降至4℃)中表现得最典型。具体而言,mi R395abcd在C4的AH和NAH处理中上调而在SC124的AH和NAH处理中下调表达,前期表型分析中AH和NAH处理下C4的低温胁迫症状小于SC124,预示着mi R395abcd的上调表达有利于木薯减轻低温伤害,其表达差异能够表征C4和SC124在耐低温性能的表型差异,且mi R395abcd对其靶基因ATRX的调控在木薯低温响应过程中起着正向保护作用。

主 题 词：mi R395abcd 靶基因 木薯 耐低温 差异表达分析 

学科分类：09[农学] 0901[农学-植物生产类] 

核心收录：

D　O　I：10.13417/j.gab.034.002441

馆 藏 号：203188060...