番薯属甘薯与牵牛EST-SSR标记开发及通用性分析

作     者：兰孟焦 吴问胜 黄水金 潘皓 Lan Mengjiao;Wu Wengsheng;Huang Shuijin;Pan Hao

作者机构：江西省农业科学院作物研究所南昌330200 

基　　金：江西省农业科学院创新基金(2012CQN005) 现代农业产业技术体系建设专项(CARS-11-C-08)共同资助 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2015年第13卷第12期

页      码：2761-2766页

摘      要：通过对番薯(Ipomoea)属的12 812条甘薯和28 422条牵牛EST唯一序列进行检索分析,在319条甘薯EST序列中发现了共328个EST-SSRs,平均每20.41 kb出现1个甘薯SSR;在936条牵牛EST序列中发现962个EST-SSRs,平均每17.87 kb出现1个SSR;在检索到的甘薯和牵牛EST-SSRs中,二核苷酸重复类型的SSR最多,分别占各自检索总数的44.51%和40.64%。利用SSR-ESTs分别设计了36对甘薯EST-SSR引物和92对牵牛EST-SSR引物,其中有28对甘薯引物在8个甘薯品种中有扩增产物,13对引物扩增产物具有多态性,多态性引物占所设计甘薯引物的36.1%;42对牵牛EST-SSR引物在甘薯基因组中可以扩增出清晰的条带,其中19对有表现较好的多态性,占设计的牵牛EST-SSR引物的20.7%。结果表明,牵牛EST-SSR标记在甘薯上具有通用性,可用于甘薯基因组多样性分析。

主 题 词：甘薯 牵牛 EST-SSR 通用性 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 090102[090102] 

核心收录：

D　O　I：10.13271/j.mpb.013.002761

馆 藏 号：203188254...