小麦淀粉合成相关酶基因SSⅡa、SBEⅡa和SBEⅡb表达序列多态性及对淀粉质量分数的影响

作     者：韩俊杰 王昊龙 李咏 蔡曼 李卫华 HAN Junjie;WANG Haolong;LI Yong;CAI Man;LI Weihua

作者机构：石河子大学农学院新疆兵团绿洲生态农业重点实验室新疆石河子832003 

基　　金：国家自然科学基金(31260357) 

出 版 物：《西北农业学报》 (Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica)

年 卷 期：2016年第25卷第8期

页      码：1150-1157页

摘      要：为了探究小麦淀粉合成相关酶SSⅡa、SBEⅡa和SBEⅡb基因表达序列核苷酸多态性及其与淀粉质量分数的关系,根据GenBank中已公布的基因序列设计特异引物,克隆基因的表达序列并测序,通过Clustal X2比对分析,用Dnasp 5.0计算核苷酸多态性信息,并建树做单倍型与淀粉质量分数的相关分析。结果表明,克隆得到3个基因的ORF(Open reading frame)序列,NCBI/Blast同源比对SSⅡa、SBEⅡa和SBEⅡb与GenBank中已登记的序列的同源性分别为98.19%、98.64%和99.04%。在SSⅡa、SBEⅡa和SBEⅡb中分别发现40、14和18个SNP位点,其中共包括4个InDel。在SSⅡa中,其第2外显子区为变异富集区,Tajima’s D检验D值均不显著。可见,这3个基因的多态性信息均较丰富,其单核苷酸多态性与小麦淀粉质量分数之间存在一定的对应关系。

主 题 词：小麦 表达序列 核苷酸多态性 淀粉质量分数 

学科分类：09[农学] 0901[农学-植物生产类] 

D　O　I：10.7606/j.issn.1004-1389.2016.08.006

馆 藏 号：203189669...