杜氏盐藻psaB基因cDNA克隆及系统进化分析(英文)

作     者：鲁照明 刘红涛 臧卫东 薛乐勋 LU Zhao-Ming;LIU Hong-Tao;ZANG Wei-Dong;XUE Le-Xun

作者机构：郑州大学细胞生物学研究室郑州450052 

基　　金：国家自然科学基金(30600006) 河南省医学科技创新人才工程项目(2001006)~~ 

出 版 物：《广西植物》 (Guihaia)

年 卷 期：2007年第27卷第2期

页      码：224-230,235页

摘      要：根据真核生物莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)、Chlamydomonas moewusii及Chlorella vulgaris等光系统Ⅰ反应中心蛋白psaB基因的氨基酸高度保守序列,设计一对简并引物,利用TRIzol试剂提取杜氏盐藻(Dunaliella salina)细胞的总RNA,通过RT-PCR,得到的一段长为1.8kb左右的cDNA片段。PCR产物经T-A克隆并测序以及测序结果推导成氨基酸序列进行同源性比较,表明所克隆的1815bp序列为杜氏盐藻光系统Ⅰ反应中心psaB基因的cDNA片段,GenBank收录号为AY820754。根据已经得到的psaB的核苷酸序列推导成氨基酸序列与一些已知物种的psaB氨基酸序列相比较,同源性分别为Chlamydomonas reinhardtii 92%,Chlamydomonas moewusii 91%,Chlorella vulgaris 86%,Mesostigma viride 85%,Phy -scomitrella *** 85%,Nephroselmis olivacea 84%。此外,psaB密码子偏爱性分析表明:杜氏盐藻psaB基因第三位密码子A和T的组成分别为35.7%和39.17%,而G和C分别为7.27%和17.85%,即杜氏盐藻psaB基因密码子的组成大多为NNA和NNT。根据psaB基因的特征,作者对绿藻门的50个物种的psaB基因作了进化分析,结果表明:杜氏盐藻与Haematococcaceae中的大多数种类进化地位最为接近,这为更进一步弄清杜氏盐藻的遗传背景提供了理论依据。

主 题 词：杜氏盐藻 A2亚基 psaB cDNA 简并引物 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 090102[090102] 

核心收录：

D　O　I：10.3969/j.issn.1000-3142.2007.02.016

馆 藏 号：203193841...