猪H-FABP基因第2内含子SNPs分布及连锁不平衡遗传模式研究

作     者：王立刚 张龙超 赵克斌 颜华 王立贤 WANG Li-gang;ZHANG Long-chao;ZHAO Ke-bin;YAN Hua;WANG Li-xian

作者机构：中国农业科学院北京畜牧兽医研究所北京100193 

基　　金：国家高技术发展计划"863"项目(2008AA10Z133 2008AA101008) 中国农业科学院基本科研业务费专项(2010jc-4)资助 

出 版 物：《中国畜牧兽医》 (China Animal Husbandry & Veterinary Medicine)

年 卷 期：2011年第38卷第1期

页      码：122-125页

摘      要：本研究以藏猪、鄂西黑猪、大白猪、莱芜黑猪、北京黑猪、野猪、荣昌猪、八眉猪和里岔黑猪等国内外9个品种16头猪为研究对象,应用Primer Premier 5.0软件设计引物对心脏脂肪酸结合蛋白(heart fatty acid binding protein,H-FABP)基因第2内含子进行扩增测序后拼接,获得了长2078 bp的第2内含子全序列,发现了14个位点的SNPs;对所有突变进行Hudson-Kreitman-Aguade测验等遗传分布分析结果发现,西南型、高原型猪核酸分布值(π)、Tajima’s D测验值(DT)、Fu和Li’s D测验值(DFu and Li)分别为0.18%、-0.52和-0.30,华北型猪π、DT和DFu and Li分别为0.25%、0.76和0.72,培育和国外品种猪π值为0.29%;对所有类型的猪进行分析,其π、DT和DFu and Li分别为0.25%-、0.60和-0.17,在不同的猪种中各个位点的SNPs变异很大,对其进行构建进化树等一系列分析,得到相似结论,并最终推断出可能会影响肌内脂肪(intra muscular fat,IMF)含量的突变位点,为研究H-FABP与IMF的关系提供了理论基础。

主 题 词：猪 H-FABP基因 多态性 肌内脂肪 候选基因 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 071007[071007] 

馆 藏 号：203195285...