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基于生物信息学技术筛选影响胶质母细胞瘤化疗敏感性相关基因的研究

基于生物信息学技术筛选影响胶质母细胞瘤化疗敏感性相关基因的研究

作     者:赵振宇 卢亦成 陈菊祥 侯立军 胡国汉 骆纯 ZHAO Zhen-yu;LU Yi-chcng;CHEN Ju-xiang;HOU Li-jun;HU Guo-han;LUO Chun

作者机构:第二军医大学长征医院神经外科上海200003 

基  金:国家自然科学基金重点项目(30930094) 国家863项目(2007AA02Z483) 

出 版 物:《现代生物医学进展》 (Progress in Modern Biomedicine)

年 卷 期:2011年第11卷第19期

页      码:3601-3604页

摘      要:目的:应用生物信息学技术筛选影响胶质母细胞瘤(GBM)化疗敏感性的相关基因。方法:对2批胶质瘤患者BIOSTAR基因芯片进行分析。通过随访完善临床资料,筛选芯片中胶质母细胞瘤患者生存期长、短两组间的差异基因,明确差异基因参与的功能和通路,并构建与烷化剂相关基因的信号传导网络,结合芯片数据、患者预后和信号传导网络,筛选GBM化疗敏感性的相关基因。结果:两组芯片中间差异基因有503条。2批芯片的差异基因主要参与62项基因功能,主要参与31条信号传导通路。通过对差异基因功能、通路,烷化剂信号转导网络的分析,得到影响胶质母细胞瘤化疗敏感性的核心的差异基因IFNGR2、IL8、ITGA5、TNFRSF1B。结论:通过严谨的实验设计和科学的统计学判别,结合患者完整的生存资料,本研究成功地应用生物信息学技术对基因芯片的大量数据进行挖掘和分析,并筛选出了可能影响GBM患者预后和化疗药物敏感性的基因,为进一步功能实验和患者个体化治疗奠定了基础。

主 题 词:胶质母细胞瘤 基因芯片 生物信息学 化疗敏感性 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 1002[医学-临床医学类] 07[理学] 09[农学] 100214[100214] 10[医学] 

D O I:10.13241/j.cnki.pmb.2011.19.049

馆 藏 号:203195600...

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