基于甲骨文数据库管理系统的化学结构检索数据库的设计与实现

作     者：苏振强 廖晨钟 谢爱华 鲁先平 石乐明 

作者机构：深圳微芯生物科技有限责任公司广东深圳518057 

基　　金：国家863高新技术研究发展计划资助项目(2002AA234021 2002AA234041 2002AA104270 2002AA223146) 广东省2002年生物技术新药-抗Ⅱ型糖尿病Ⅰ类新药开发项目 深圳市药物创新平台与新药开发项目 

出 版 物：《计算机与应用化学》 (Computers and Applied Chemistry)

年 卷 期：2003年第20卷第5期

页      码：556-562页

摘      要：设计了一种基于大型数据库管理系统Oracle的化学结构数据存储模式,并实现了相应于此模式的高效化学结构检索方法。结构检索方法建立在图子图匹配算法VF2的基础上,对其进行了必要的改造和扩展,使之适合于化学结构检索。在此基础上,针对美国NCI(National Cancer Institute)25万个化合物的2D结构建立了数据库,成功进行了结构检索试验。结果表明,这种实现方法不仅能高效存储并准确检索化合物的结构信息,而且也容易实现与药物研发过程中所产生的大量其它数据(如生物筛选数据和DNA芯片基因表达数据等)进行高效整合。这个设计的改进版已经集成于微芯公司的药物研发生化信息学软件系统——TASS(Target Activity Structure System)中。

主 题 词：甲骨文数据库管理系统 化学结构数据库 结构检索 化学基因组学 药物开发 

学科分类：1007[医学-药学类] 100701[100701] 10[医学] 

核心收录：

D　O　I：10.3969/j.issn.1001-4160.2003.05.003

馆 藏 号：203202550...