基于数据库信息的取代基选择

作     者：乔园园 宋端磊 孙可 Qiao Yuanyuan;Song Duanlei;Sun Ke

作者机构：南开大学化学院中心实验室天津300071 

出 版 物：《计算机与应用化学》 (Computers and Applied Chemistry)

年 卷 期：2008年第25卷第8期

页      码：1027-1030页

摘      要：虚拟组合衍生程序能够快速地根据选定的取代基生成大量的虚拟分子,问题在于选择什么样的取代基,才更有目的地控制衍生分子,使它们与受体的结合有更大的成功保障。通过统计数据库中蛋白质残基及其对应的配体取代基,就可以根据目标受体的残基情况,选择那些统计频率较高的取代基,这样比随机地选择取代基会更有目的性,设计的配体更有可能与蛋白质残基有效地发生作用。因此,这是一种新型的、基于数据库信息的概率式取代基选择方法,简称SSDI。SSDI用统计概率的方式,回答了组合衍生所面临的选择什么样取代基的问题。

主 题 词：虚拟组合化学 取代基 残基 相互作用 频率 

学科分类：1007[医学-药学类] 07[理学] 0703[理学-化学类] 100701[100701] 10[医学] 

核心收录：

D　O　I：10.3969/j.issn.1001-4160.2008.08.026

馆 藏 号：203202550...