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芋头过氧化物酶基因克隆

芋头过氧化物酶基因克隆

作     者:莫俊杰 梁钾贤 胡汉桥 黄红 陈妤 MO Jun-jie LIANG Jia-xian HU Han-qiao HUANG Hong CHEN Yu

作者机构:广东海洋大学农学院广东湛江524088 

基  金:国家公益性行业(农业)科研专项经费子课题分项目(200903017-08) 

出 版 物:《广东农业科学》 (Guangdong Agricultural Sciences)

年 卷 期:2016年第43卷第9期

页      码:37-43页

摘      要:根据芋头的密码子使用频率,用i CODEHOP设计简并引物扩增芋头过氧化物酶基因序列,待芋头过氧化物酶基因非侧翼序列扩增成功后,依据其序列合成hiTAIL-PCR引物扩增芋头过氧化物酶基因的两侧序列。结果从芋头基因组DNA中克隆出1 165 bp序列,经同源性分析为过氧化物酶基因的部分序列;再利用hiTAIL-PCR技术可以扩增出芋头过氧化物酶基因的两侧序列,扩增序列为689 bp,测序结果能与1 165 bp序列拼接到一起,长1 854 bp。与已知的过氧化物酶进行序列比对,发现两侧还有氨基酸的编码序列,因此进行第2次hiTAIL-PCR,扩增出165 bp芋头过氧化物酶基因的侧翼序列,拼接后得到2 019bp。用Softberry上的基因预测软件分析后,发现包含过氧化物酶4个外显子,同源性分析表明,此过氧化物酶基因为含血红素的第三类过氧化物酶。

主 题 词:芋头 过氧化物酶基因 hiTAIL—PCR 克隆 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0902[农学-自然保护与环境生态类] 0836[0836] 090102[090102] 090202[090202] 

D O I:10.16768/j.issn.1004-874X.2016.09.006

馆 藏 号:203207596...

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