抗菌肽LL-37序列分析与结构研究

作     者：杨浩 罗鹏程 付靖瑜 胡芳 汪宏良 YANG Hao;LUO Peng-cheng;FU Jing-yu;HU Fang;WANG Hong-liang

作者机构：鄂东医疗集团黄石市中心医院湖北理工学院附属医院医学检验科肾脏疾病发生与干预湖北省重点实验室湖北黄石435000 

基　　金：湖北省自然科学基金项目(2015CFB627) 黄石市科技计划项目(2013A077-4) 

出 版 物：《中华医院感染学杂志》 (Chinese Journal of Nosocomiology)

年 卷 期：2016年第26卷第22期

页      码：5076-5079页

摘      要：目的分析抗菌肽LL-37的序列和结构特征,模拟其与棕榈酰转移酶PagP三维结构的结合,为后续研究抗菌机制提供理论和实验基础。方法从PDB数据库获得抗菌肽LL-37、棕榈酰转移酶PagP的序列和结构信息,使用SWISS-MODEL、NCBI在线工具和ANTHEPROT6.6.6、AutoDock4.2等软件对抗菌肽LL-37进行序列和结构分析。结果抗菌肽LL-37序列全长为37个氨基酸,含有75.7%α螺旋和24.3%无规则卷曲,抗菌肽LL-37片段与棕榈酰转移酶PagP形成8种对接模式,其配体效率在-2.2389^-1.6100Kcal/mol之间。结论对抗菌肽LL-37的序列和结构研究,为后续针对特异靶点设计多肽药物,开展结构与活性的研究提供了新的方向。

主 题 词：抗菌肽LL-37 生物信息学 棕榈酰转移酶PagP 

学科分类：1001[医学-基础医学] 100102[100102] 10[医学] 

D　O　I：10.11816/cn.ni.2016-161585

馆 藏 号：203208198...