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HIV-1逆转录酶的分子对接及运动功能相关性分析

HIV-1逆转录酶的分子对接及运动功能相关性分析

作     者:杜文义 胡建平 左柯 梁立 刘嵬 苟小军 DU Wen-Yi;HU Jian-Ping;ZUO Ke;LIANG Li;LIU Wei;GOU Xiao-Jun

作者机构:成都大学药食同源植物资源开发重点实验室成都610106 乐山师范学院化学学院乐山614004 

基  金:国家自然科学基金(11247018 11147175) 四川省教育厅科研重点项目(12ZA066) 乐山市科技计划项目(14SZD018) 

出 版 物:《原子与分子物理学报》 (Journal of Atomic and Molecular Physics)

年 卷 期:2016年第33卷第6期

页      码:963-972页

摘      要:目的研究逆转录酶的运动性和生理功能的关系,以及N-乙酰基-β-芳基-1,2-二脱氢乙胺类衍生化合物与其的分子识别,方法采用高斯网络模型和各向异性网络模型研究了p66和p66-DNA的运动模式差异,并用分子对接方法研究化合物与逆转录酶的识别.结果 DNA的结合对p66各区域的运动方向影响不大,但其运动的幅度大大降低.分子对接结果发现Y115和M184的疏水结构在识别的过程中起到重要作用.结论基于各个区域的运动方向分析,推测手指区和RNase H区的开合运动可能是逆转录酶发挥逆转录功能的重要原因.并且,N-乙酰基-β-芳基-1。

主 题 词:HIV-1逆转录酶 高斯网络模型 各向异性网络模型 分子对接 新药设计 

学科分类:081704[081704] 07[理学] 070304[070304] 08[工学] 0817[工学-轻工类] 0703[理学-化学类] 

核心收录:

D O I:10.3969/j.issn.1000-0364.2016.12.002

馆 藏 号:203208205...

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