川山茶ISSR-PCR及SSR-PCR优化体系建立及比较

作     者：刘家艳 权俊萍 沈薛洁 卢娟芳 田波 陈启航 LIU Jia-yan;QUAN Jun-ping;SHEN Xue-jie;LU Juan-fang;TIAN Bo;CHEN Qi-hang

作者机构：重庆市南山植物园管理处重庆400065 西南大学园艺园林学院重庆400716 

基　　金：重庆市科学技术委员会基础前沿研究项目(cstc2014jcyj A1669) 重庆市园林局科技示范项目(园科字2013(9)) 

出 版 物：《江苏林业科技》 (Journal of Jiangsu Forestry Science & Technology)

年 卷 期：2016年第43卷第5期

页      码：1-7页

摘      要：以川山茶品种"茶睡莲"为试验材料,以改良CTAB法提取高质量DNA,采用正交设计L16(45),探讨了Mg^(2+)、dNTPs、引物、TaqDNA聚合酶和模板DNA浓度对川山茶ISSR-PCR和SSR-PCR反应体系的影响。建立了相关优化体系:20μL的ISSR-PCR扩增体系中含20 ng模板DNA,2μL10×Buffer,2 mmol/L Mg^(2+),0.15 mmol/L dNTPs,0.6μmol/L引物和1 U TaqDNA聚合酶,扩增退火温度为55℃,35个循环;20μL的SSR-PCR扩增体系中含50 ng模板DNA,2.5 mmol/L Mg^(2+),0.05 mmol/L dNTPs,0.2μmol/L引物和0.5 U TaqDNA聚合酶,最佳退火温度为52℃,最佳循环数为38。应用该优化体系,分别用27个川山茶品种DNA进行了ISSR-PCR扩增和SSR-PCR扩增,结果显示,建立的优化体系具有较高稳定性。

主 题 词：川山茶 ISSR-PCR SSR-PCR 引物 退火温度 TaqDNA聚合酶 正交设计 优化体系 

学科分类：090706[090706] 0907[农学-草药学] 09[农学] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1001-7380.2016.05.001

馆 藏 号：203208225...