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NLRP3基因单核苷酸多态性TaqMan探针实时荧光PCR检测方法的建立

NLRP3基因单核苷酸多态性TaqMan探针实时荧光PCR检测方法的建立

作     者:刘胜牙 朱玉兰 甄胜西 谢聪贤 李微 刘健平 LIU Sheng-ya ZHU Yu-lan ZHEN Sheng-xi XIE Cong-xian LI Wei LIU Jian-ping

作者机构:深圳国际旅行卫生保健中心广东深圳518033 深圳市检验检疫科学研究院 深圳市疾病预防控制中心 

基  金:深圳市科技计划项目(JCYJ20120618172144499) 

出 版 物:《中国国境卫生检疫杂志》 (Chinese Journal of Frontier Health and Quarantine)

年 卷 期:2016年第39卷第5期

页      码:310-313,379页

摘      要:目的建立以Taq Man探针实时荧光PCR技术为基础的核苷酸结合寡聚化结构域样受体3(Nucleotide-binding oligomerization domain,Leucine rich Repeat and Pyrin domain containing,NLRP3)基因单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)检测方法。方法以20份健康人血液样本为对象,选择NLRP3基因的两个SNP位点(rs3806265和rs35829419),针对每个位点分别设计1对PCR引物和2条Taq Man探针,进行实时荧光PCR扩增,对SNP位点进行分型。用常规PCR和基因测序的方法对Taq Man探针实时荧光PCR分型的结果进行验证。结果用建立的Taq Man探针实时荧光PCR分型法对20份样本进行检测,其中rs3806265位点发现TT基因型3份,TC基因型8份,CC基因型9份;rs35829419位点发现CC基因型20份,无AC和AA基因型。分型结果与常规PCR及基因测序分型方法完全一致。结论基于Taq Man探针技术的实时荧光PCR方法简单、快速,可实现对NLRP3基因位点的分型检测。

主 题 词:TaqMan探针 实时荧光PCR 单核苷酸多态性 NOD样受体蛋白3 

学科分类:1001[医学-基础医学] 100102[100102] 10[医学] 

D O I:10.16408/j.1004-9770.2016.05.002

馆 藏 号:203208245...

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