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刚地弓形虫529 bp重复序列环介导等温扩增检测方法的建立

刚地弓形虫529 bp重复序列环介导等温扩增检测方法的建立

作     者:徐前明 袁恒青 赵长城 方芬 刘喆 宁红蕊 石大丽 李郁 王海洋 

作者机构:安徽农业大学动物科学技术学院合肥230036 中国农业科学院兰州兽医研究所兰州730046 

基  金:安徽省高等学校自然科学基金(No.030870360)~~ 

出 版 物:《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 (Chinese Journal of Parasitology and Parasitic Diseases)

年 卷 期:2016年第34卷第5期

页      码:444-447,450页

摘      要:目的 建立高效检测刚地弓形虫(Toxoplama gondii)的环介导等温扩增(LAMP)方法,为弓形虫病诊断提供新的技术手段。 方法 采用在线引物设计软件Primer Explorer 4.0设计弓形虫529 bp基因LAMP扩增引物,用已构建的pMD-19T-529 bp重组质粒为模板,建立LAMP扩增反应,通过添加环引物、设置不同浓度的甜菜碱和MgSO4以及不同反应温度对扩增反应体系和反应条件进行优化。以猪、微小隐孢子虫(Cryptosporidium parvum)、猪等孢球虫(Isospora suis)的基因组DNA和超纯水为对照,pMD-19T-529 bp重组质粒为模板,分别进行优化后的LAMP和PCR扩增,评价LAMP方法的特异性。将pMD-19T-529 bp重组质粒梯度稀释为109~100 copies/ml,分别进行优化后的LAMP和PCR扩增,评价LAMP方法的灵敏性。 结果 设计的LAMP扩增引物可扩增出弓形虫529 bp序列保守区域的目的片段。优化结果显示,最佳反应总体系为25 μl,其中,甜菜碱最佳浓度为0.4 mol/L,MgSO4最佳浓度为6 mmol/L;添加环引物反应30 min的扩增效率与未添加环引物反应60 min的扩增效率相当,可使反应时间缩短30 min;最佳反应条件为63 ℃ 30 min,80 ℃ 3 min。特异性检测结果显示,所建立的LAMP方法可特异扩增弓形虫529 bp基因片段, 对照均未扩增出目的片段。灵敏性检测结果显示,LAMP方法的最低检出值达103 copies/ml,效率为PCR扩增(104 copies/ml)的10倍。 结论 建立了弓形虫529 bp重复序列的LAMP检测方法,该法具有较好的特异性和灵敏性。

主 题 词:刚地弓形虫 529 bp重复序列 环介导扩增 建立 

学科分类:1002[医学-临床医学类] 1001[医学-基础医学] 100103[100103] 10[医学] 

核心收录:

馆 藏 号:203208482...

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