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寡核苷酸芯片技术检测中国肝细胞癌p53基因点突变

寡核苷酸芯片技术检测中国肝细胞癌p53基因点突变

作     者:陈可和 冯国生 丁志敏 张法灿 陈振祥 孙美倩 李瑶 CHEN Kehe;FENG Guosheng;DING Zhimin;ZHANG Facan;CHEN Zhengxiang;SUN MeiQian;LI Yao

作者机构:广西壮族自治区人民医院肿瘤科南宁530021 复旦大学遗传工程国家重点实验室上海200032 

基  金:2004年广西壮族自治区科技厅自然科学基金项目(项目号:桂科自0447026) 2003年广西壮族自治区卫生厅自筹基金项目(项目号:桂卫ZZ2003085) 

出 版 物:《内科》 (Internal Medicine)

年 卷 期:2006年第1卷第1期

页      码:12-15,99页

摘      要:目的探讨寡核苷酸芯片技术在我国肝细胞癌p53基因点突变发生频率及形式,并以DNA测序法进行验证。方法参照国际p53突变公共数据库资料,以发生频率最高的7个点突变序列设计探针,制备p53基因点突变专用寡核苷酸芯片,应用该技术检测我国肝细胞癌p53基因7个常见突变位点的突变频率及形式,以DNA测序法验证结果,比较不同分组时p53基因点突变差异。结果共检测肝细胞癌石蜡包埋标本54例,p53基因突变率为38.9%(21/54)。54例中广西肝癌高发病区组17例,广西低发病区组(低发区组)19例,区(省)外组18例,三组突变率分别为47%、21%、50%。p53突变主要发生在249编码区,主要突变形式为249ser突变(由AGG→AGT,第三碱基G→T颠换);以DNA测序法对结果进行验证,两种技术检测结果重合率100%。结论寡核苷酸芯片技术可作为检测肝癌p53基因突变的一种新的、可靠和便捷的手段;我国肝癌不同地区之间p53基因突变在频率及形式上既有差异性又有类似性,可能预示不同地区肝细胞癌的病因学异同性。

主 题 词:寡核苷酸芯片技术 技术检测 中国 肝细胞癌 p53基因点突变 Oligonucleotide Microarray Hepatocellular Carcinoma p53基因突变 DNA测序法 形式 发生频率 检测结果 p53突变 验证 突变率 低发区组 肝癌 公共数据库 序列设计 突变位点 

学科分类:1002[医学-临床医学类] 100214[100214] 10[医学] 

D O I:10.3969/j.issn.1673-7768.2006.01.006

馆 藏 号:203208681...

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