文心兰EST-SSR标记的开发及其在遗传多样性分析中的应用

作     者：林榕燕 钟淮钦 黄敏玲 罗远华 Lin Rongyan;Zhong Huaiqin;Huang Minling;Luo Yuanhua

作者机构：福建省农业科学院作物研究所福州350013 福建省农业科学院花卉研究中心福州350013 福建省特色花卉工程技术研究中心福州350013 

基　　金：福建省种业创新与产业化工程项目(2014S1477-14) 福建省林业科学研究项目(闽林种站42号) 福建省农业科学院科技创新团队建设(CXTD-2-17) 省属公益类科研院所专项(2014R1026-9)共同资助 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2016年第14卷第11期

页      码：3113-3119页

摘      要：本研究基于NCBI数据库中文心兰的EST序列,对其EST-SSR标记进行分析,并设计了20对EST-SSR引物用于30个文心兰品种遗传多样性性分析研究。对3 183条文心兰EST序列进行搜索,共检索出274个SSR位点,检出率为8.61%。二核苷酸重复类型是文心兰EST-SSR的主要重复类型,占60.58%。通过PCR扩增检测到13对引物有扩增产物,其中10对引物有多态性,平均每对引物扩增到10个多态性条带,各引物的多态性比率分布为75.00%~100.00%,多态性信息含量变化范围为0.69~0.93。聚类分析发现30个文心兰品种间的遗传距离变化在0.04~0.58,且在遗传距离为0.39处可将30个文心兰品种分为7大聚类群。

主 题 词：文心兰 EST-SSR 多态性 遗传多样性 

学科分类：090706[090706] 0907[农学-草药学] 09[农学] 

核心收录：

D　O　I：10.13271/j.mpb.014.003113

馆 藏 号：203208708...