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反向重复序列DNA的PCR扩增特性研究

反向重复序列DNA的PCR扩增特性研究

作     者:李春川 潘孝明 王静 董平 李敬 梁兴国 LI Chun-chuan;PAN Xiao-ming;WANG Jing;DONG Ping;LI Jing;LIANG Xing-guo

作者机构:中国海洋大学食品科学与工程学院青岛266003 

基  金:国家自然科学基金项目(31571937 31201327) 国家自然科学基金委员会-山东省人民政府联合资助海洋科学研究中心项目(U1406402) 

出 版 物:《生物技术通报》 (Biotechnology Bulletin)

年 卷 期:2016年第32卷第12期

页      码:180-188页

摘      要:旨在研究反向重复序列形成的发卡结构对模板扩增的影响。研究DNA发卡结构中环部大小、茎部长度、引物相对于茎部位置等对PCR扩增效率的影响,探讨如何通过引物设计及改变退火温度等条件来实现发卡结构DNA的有效扩增的方法。结果显示,如果引物的位置同发卡结构茎部5 序列相同或部分相同,则由于发卡结构的形成阻碍引物与模板结合而对PCR产生抑制作用,并且抑制作用随着茎部长度的增加而增强;当环部的长度达到50 nt以上时,抑制作用明显减弱。较高的退火温度和引物浓度都有助于引物同分子内形成发卡结构的竞争,使PCR扩增更容易进行。

主 题 词:发卡结构 PCR扩增 反向重复序列 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

D O I:10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2016.12.028

馆 藏 号:203209956...

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