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木薯SCoT-PCR反应体系优化及引物筛选

木薯SCoT-PCR反应体系优化及引物筛选

作     者:严华兵 周慧文 单建伟 谢向誉 YAN Hua-bing;ZHOU Hui-wen;SHAN Jian-wei;XIE Xiang-yu

作者机构:广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室南宁530007 

基  金:国家自然科学基金项目(31301378) 广西八桂学者专项项目(桂人才通字4号) 

出 版 物:《南方农业学报》 (Journal of Southern Agriculture)

年 卷 期:2016年第47卷第10期

页      码:1648-1652页

摘      要:【目的】优化木薯SCoT-PCR反应体系并进行SCoT引物筛选,为木薯辅助育种提供技术支持。【方法】以木薯品种新选048为材料,利用正交试验设计对DNA模板量、Mg^(2+)浓度、dNTPs浓度、引物浓度、Taq DNA聚合酶量等因素进行优化,确定木薯最佳SCoT-PCR反应体系,并用其进行SCoT引物筛选。【结果】木薯最佳SCoT-PCR反应体系(20.0μL):模板DNA 60 ng,引物浓度0.30μmol/L,Taq DNA聚合酶1.5 U,Mg^(2+)1.50 mmol/L,dNTPs 0.25 mmol/L。利用该体系筛选出19条SCoT引物,能稳定扩增出数量多、清晰可辨且多态性丰富的条带。【结论】优化的木薯SCoT-PCR反应体系检测结果稳定,重复性好,且筛选出的19条引物均适用于木薯遗传多样性分析。

主 题 词:木薯 SCoT-PCR反应体系 正交试验设计 引物筛选 

学科分类:09[农学] 0901[农学-植物生产类] 

D O I:10.3969/j:issn.2095-1191.2016.10.1648

馆 藏 号:203210548...

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