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猪繁殖与呼吸综合征病毒GS株结构蛋白基因的克隆及结构特征分析

猪繁殖与呼吸综合征病毒GS株结构蛋白基因的克隆及结构特征分析

作     者:马友记 柳纪省 张利 MA You-ji;LIU Ji-xing;ZHANG Li

作者机构:甘肃农业大学动物科技学院甘肃兰州730070 中国农业科学院兰州兽医研究所甘肃兰州730046 中农威特生物科技股份有限公司甘肃兰州730046 

基  金:甘肃省自然科学基金(096RJZA008) 甘肃省科技支撑计划(0708NKCA078) 

出 版 物:《甘肃农业大学学报》 (Journal of Gansu Agricultural University)

年 卷 期:2010年第45卷第6期

页      码:1-5,17页

摘      要:根据GenBank中猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)VR-2332毒株基因序列设计合成了6对引物,应用RT-PCR方法对PRRSVGS株部分片段进行基因的扩增、克隆和测序,将测序结果应用Blast和DNAStar软件进行拼接,并与国内外分离毒株进行核苷酸以及推导氨基酸序列同源性比较.结果发现PRRSVGS毒株结构蛋白基因全长3819bp,包括ORF2、ORF3、ORF4、ORF5、ORF6和ORF7共6个阅读框,分别编码GP2、GP3、GP4、GP5、M和N蛋白;与BJ-4、CH-1a、HB-2(sh)/2002和VR-2332美洲株等核苷酸的同源性在87.9%~97.1%,推导的氨基酸同源性在88.3%~97.1%;而与LV和Euro毒株的同源性差异显著,核苷酸同源性在56.0%~70.0%,氨基酸同源性在54.9%~77.6%.构建的系统发育树证明该毒株在基因型上属于美洲型.

主 题 词:猪繁殖与呼吸综合征 结构蛋白基因 同源性 序列分析 

学科分类:090601[090601] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

D O I:10.3969/j.issn.1003-4315.2010.06.001

馆 藏 号:203210633...

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