辣椒EST-SSR标记的开发与验证

作     者：李永平 林珲 康建坂 温庆放 LI Yong-ping;LIN Hui;KANG Jian-ban;WEN Qing-fang

作者机构：福建省农业科学院蔬菜研究中心福建福州350013 福建省农业科学院作物研究所福建福州350013 

基　　金：福建省自然科学基金项目(2014J01115) 福建省科技计划重大专项(2013NZ0002-3) 

出 版 物：《福建农业学报》 (Fujian Journal of Agricultural Sciences)

年 卷 期：2016年第31卷第11期

页      码：1187-1192页

摘      要：从NCBI数据库下载118 900条辣椒相关EST,对其进行SSR位点搜索,共搜索出3 343条SSR,分布密度为1/17.20kb,共有287种重复基元。在辣椒EST-SSR中,二核苷酸(1 476个SSR)和六核苷酸(1 128个SSR)占主导地位,所占比例分别为44.15%和33.74%;出现最多的重复基元是GA/TC,占总数的14.30%,其次为CT/AG(94个,占8.11%)。针对3 343条含有SSR的EST设计合成了200对引物。用17份辣椒种质对200对引物进行筛选,196对引物有扩增产物,71对引物表现出多态性,共有220个多态性位点。利用71对多态性引物,对特定亲本P181-2-6和P230-2-5及其杂种一代F1的亲缘关系进行检测,结果说明从辣椒相关EST数据库中开发的SSR引物有较好的可用性。

主 题 词：辣椒 EST-SSR 标记开发 指纹图谱 

学科分类：09[农学] 0902[农学-自然保护与环境生态类] 090202[090202] 

D　O　I：10.19303/j.issn.1008-0384.2016.11.009

馆 藏 号：203211039...