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桉树SSR-PCR体系优化及引物筛选应用

桉树SSR-PCR体系优化及引物筛选应用

作     者:郭鑫 倪州献 罗建中 徐立安 Guo Xin Ni Zhouxian Luo Jianzhong Xu Li'an

作者机构:南京林业大学南方现代林业协同创新中心南京210037 国家林业局桉树研究开发中心湛江524022 

基  金:林业公益性行业科研专项经费(201504204) 江苏高校优势学科项目(PAPD)共同资助 

出 版 物:《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期:2017年第15卷第2期

页      码:626-632页

摘      要:以尾叶桉、细叶桉、粗皮桉为材料,采用L16(45)正交设计对SSR-PCR反应体系中的引物浓度、DNA浓度、Mg2+浓度、d NTP浓度和Taq酶含量5种因素的4个水平进行优化实验,确立了适合细叶桉、粗皮桉、尾叶桉SSR-PCR最佳反应体系,最终优化的SSR-PCR反应体系为:0.25μmol/L引物、5 ng模板DNA、3.75 mmol/L Mg2+、0.4 mmol/L d NTP、1.5 U Taq酶、1 m L 10×PCR Buffer,双蒸水补齐10μL;并利用优化的体系从74对SSR引物中筛选出12对多态性较高的引物,12对引物在3种桉树中均能扩增出条带,在尾叶桉、细叶桉、粗皮桉中的多态率分别为100%、92.86%、64.29%,为尾叶桉、细叶桉、粗皮桉的遗传多样性分析、品种鉴定、亲缘关系分析等提供了分子技术基础。

主 题 词:桉树 SSR 体系优化 引物筛选 

学科分类:0907[农学-草药学] 08[工学] 0829[工学-安全科学与工程类] 09[农学] 

核心收录:

D O I:10.13271/j.mpb.015.000626

馆 藏 号:203215732...

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