高致病性A(H5N6)亚型禽流感病毒全基因组序列测定方法的建立

作     者：李晓丹 张烨 邹淑梅 薄洪 王大燕 舒跃龙 LI Xiaodan ZHANG Ye ZOU Shumei BO Hong WANG Dayan SHU Yuelong

作者机构：中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所卫生部医学病毒和病毒病重点实验室北京102206 

基　　金：国家传染病重大专项(项目号:2014ZX10004002) 题目:人感染新型流感防控技术研究 

出 版 物：《病毒学报》 (Chinese Journal of Virology)

年 卷 期：2017年第33卷第1期

页      码：19-23页

摘      要：建立以Sanger测序方法为基础的新型A(H5N6)亚型禽流感病毒全基因组扩增方法。从GenBank和Global Initiative on Sharing All Influenza Data(GISAID)下载近五年H5亚型流感病毒的HA基因序列,N6亚型流感病毒的NA基因序列,以及H5N1和H9N2亚型流感病毒内部6个基因序列,每个基因序列分别进行比对,在相对保守区域设计用于分段扩增的引物,共32对,选用3株病例分离病毒及6株环境分离病毒对引物进行验证。优化后的32对引物能够有效地扩增9株H5N6亚型禽流感病毒,其中3株病例分离病毒的扩增产物条带单一,无非特异扩增。6株环境标本分离病毒扩增产物中,个别反应有非特异扩增产物。建立了一种能够获得高致病性H5N6亚型禽流感病毒全基因组序列的Sanger测序方法,该方法简单、快速,为新型H5N6亚型禽流感病毒的进化分析提供了基础。

主 题 词：流感病毒 A(H5N6) 全基因组 序列测定 

学科分类：1007[医学-药学类] 100705[100705] 1001[医学-基础医学] 100103[100103] 10[医学] 

核心收录：

D　O　I：10.13242/j.cnki.bingduxuebao.003092

馆 藏 号：203215881...