基于沙棘转录组序列开发EST-SSR分子标记

作     者：李珊珊 曾艳飞 何彩云 张建国 LI Shan-shan ZENG Yan-fei HE Cai-yun ZHANG Jian-guo

作者机构：国家林业局林木培育重点实验室中国林业科学研究院林业研究所北京100091 南京林业大学南方现代林业协调创新中心江苏南京210037 

基　　金：林业公益性行业科研专项(201504103) 

出 版 物：《林业科学研究》 (Forest Research)

年 卷 期：2017年第30卷第1期

页      码：69-74页

摘      要：[目的]本研究通过对蒙古沙棘"向阳"品种的转录组序列进行SSR引物开发,为沙棘亲本分析、遗传多样性和遗传育种等研究提供支持。[方法]利用已测得的转录组序列进行分析和筛选,整理具有SSR位点的序列,进行引物设计,随机挑选179条引物进行验证。[结果]得到具有SSR位点的EST序列17 383条,其中,单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸重复基元分别占62.77%、21.82%和13.77%;二核苷酸重复基元类型以AT和AG为主,三核苷酸重复基元类型以AAG、ATC和ATA为主。9 291条序列设计出扩增EST-SSR位点的引物,随机合成的179对引物中,142对扩增成功,选取其中92个位点的扩增产物上机检测,40个SSR位点(43.48%)呈现多态。对扩增稳定且峰图清晰的17个多态位点的进一步分析,得到蒙古沙棘天然群体在各位点的观测杂合度(HO)为0.083 0.875,期望杂合度(HE)为0.180 0.750。[结论]本研究开发出的EST-SSR标记,为后期进行沙棘属植物遗传多样性分析、遗传图谱构建及分子育种等研究提供了重要支持。

主 题 词：沙棘 转录组 EST-SSR 引物 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 0830[工学-生物工程类] 090701[090701] 0907[农学-草药学] 07[理学] 0829[工学-安全科学与工程类] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0902[农学-自然保护与环境生态类] 0713[0713] 

核心收录：

D　O　I：10.13275/j.cnki.lykxyj.2017.01.0010

馆 藏 号：203216075...