陕西省部分地区猪圆环病毒2型全基因组的遗传变异分析

作     者：徐丽美 付明哲 何亚鹏 许信刚 于三科 张琪 XU Li-mei;FU Ming-zhe;HE Ya-peng;XU Xin-gang;YU San-ke;ZHANG Qi

作者机构：西北农林科技大学动物医学院陕西杨凌712100 

基　　金：陕西省农业科技创新与攻关项目(2016NY-095) 西北农林科技大学基本科研业务费项目(Z109021427) 

出 版 物：《动物医学进展》 (Progress In Veterinary Medicine)

年 卷 期：2017年第38卷第3期

页      码：22-26页

摘      要：为了解陕西省猪圆环病毒2型(PCV2)的遗传变异情况,根据GenBank登录的PCV2全基因组序列,设计1对引物,从陕西省部分地区规模化猪场疑似PCV2感染的病猪采集病料9份,应用PCR扩增PCV2的全基因,其中6份为阳性,并对扩增的6个PCV2全基因组序列进行测序和序列分析。基因测序表明,PCV2基因组全长为1 767bp;对6株病毒序列进行同源性比较,6个毒株全基因之间核苷酸同源性为98.3%~100%,与GenBank上已发表的国内外毒株全基因组比较,同源性为96.3%~97.8%;与近几年陕西株比较发现基因变异程度不稳定,与2013年分离株(KX352154.1)同源性最高,2015年分离株(KX352159.1)次之,反而与2014年分离株(KX068219.1)最低;对6个毒株的ORF1和ORF2基因进行同源性比较,6个毒株的ORF1和ORF2基因的核苷酸同源性分别为98.1%~100%和98.2%~100%,与GenBank上已发表的国内外参考株ORF1和ORF2基因进行同源性比较,同源性分别为97.6%~99.8%和91.5~96.0%。陕西省流行的PCV2基因组较为保守,变异不大,同源性很高。

主 题 词：猪圆环病毒2型 全基因 序列分析 

学科分类：090601[090601] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

D　O　I：10.16437/j.cnki.1007-5038.2017.03.005

馆 藏 号：203216263...