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树鼩Tssk6基因cDNA克隆、组织表达谱及生物信息学分析

树鼩Tssk6基因cDNA克隆、组织表达谱及生物信息学分析

作     者:李元吉 杨明华 刘芳 朱方方 和绍禹 匡海鸥 李亚辉 LI Yuan-ji YANG Ming-hua LIU Fang ZHU Fang-fang HE Shao-yu KUANG Hai-ou LI Ya-hui

作者机构:云南农业大学动物科学技术学院昆明650201 云南农业大学食品科学技术学院昆明650201 

基  金:国家自然科学基金(31460308) 国家自然科学基金专项基金(31040055) 云南中科灵长类生物医学重点实验室开放基金(云中科字2016-008号) 

出 版 物:《中国畜牧兽医》 (China Animal Husbandry & Veterinary Medicine)

年 卷 期:2017年第44卷第3期

页      码:619-627页

摘      要:本研究旨在克隆出树鼩Tssk6基因cDNA的全长序列,阐明其组织表达谱及基本生物信息学特征。以GenBank中收录的树鼩Tssk6基因mRNA预测序列为参考设计特异性引物,对树鼩Tssk6基因的cDNA全长序列进行克隆,用实时荧光定量PCR检测该基因在树鼩不同组织中的表达情况,并对cDNA序列的CDS区核苷酸序列与蛋白质结构进行了生物信息学分析。结果显示,树鼩Tssk6基因cDNA的CDS区序列长度为822bp,编码273个氨基酸;Tssk6基因仅表达于树鼩睾丸组织;对树鼩和其他8种哺乳动物Tssk6基因cDNA的CDS区核苷酸序列构建的系统进化树显示,树鼩与人、黑猩猩、恒河猴3种灵长类动物亲缘关系较近,与小鼠、大鼠、金仓鼠3种啮齿类动物亲缘关系较远。本研究为进一步研究树鼩Tssk6基因的功能奠定了基础。

主 题 词:树鼩 Tssk6基因 cDNA 克隆 生物信息学 实时荧光定量PCR 

学科分类:10[医学] 

D O I:10.16431/j.cnki.1671-7236.2017.03.001

馆 藏 号:203218095...

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