大肠杆菌外膜蛋白OmpC的生物信息学分析及表位多肽疫苗的重组预测

作     者：俱雄 党亚锋 刘祥 丁锐 陈琛 冯自立 张辰露 JU Xiong DANG Yafeng LIU Xiang DING Rui CHEN Chen FENG Zili ZHANG Chenlu

作者机构：陕西理工大学中德天然产物研究所陕西汉中723001 陕西省天麻山茱萸工程技术研究中心陕西汉中723001 汉中市食品药品检验检测中心陕西汉中723000 

基　　金：陕西省农业科技创新与攻关项目(2016NY-088) 陕西理工大学校级科研项目(SLGKY16-13) 

出 版 物：《河南农业大学学报》 (Journal of Henan Agricultural University)

年 卷 期：2017年第51卷第1期

页      码：94-100页

摘      要：为设计大肠杆菌外膜蛋白OmpC的表位多肽重组疫苗,进一步提高OmpC蛋白的免疫效果,通过生物信息学软件对OmpC蛋白的进化关系、高级结构与细胞表位进行分析。结果表明,大肠杆菌、沙门伤寒菌、肺炎克雷伯菌,这3种细菌具有较高同源性,OmpC蛋白可能对这3种菌株的感染起到交叉免疫保护作用。OmpC为亲水性蛋白,1~21位氨基酸为信号肽位置,无跨膜结构并定位于细胞膜外;OmpC二级结构中含无规则卷曲43.05%,a-螺旋16.08%,β-转角0%,β-片层40.87%。OmpC蛋白可能存在5个优势B细胞表位,1个CTL表位,1个Th细胞表位;并重组拼接获得抗原性较好的OmpC蛋白表位多肽。

主 题 词：大肠杆菌 OmpC蛋白 表位疫苗 抗原分析 

学科分类：08[工学] 09[农学] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

D　O　I：10.16445/j.cnki.1000-2340.2017.01.017

馆 藏 号：203218182...