甘蔗花叶病毒南城分离物外壳蛋白基因序列测定及分析

作     者：蒋军喜 钱亚娟 谢艳 阙海勇 罗有强 向妙莲 JIANG Jun-xi;QIAN Ya-juan;XIE Yan;QUE Hai-yong;LUO You-jiang;XIANG Miao-lian

作者机构：江西农业大学农学院江西南昌330045 浙江大学生物技术研究所浙江杭州310029 

基　　金：江西省自然科学基金资助项目(0330077) 

出 版 物：《江西农业大学学报》 (Acta Agriculturae Universitatis Jiangxiensis)

年 卷 期：2008年第30卷第3期

页      码：464-467页

摘      要：从江西南城甘蔗病株中获得1个甘蔗花叶病毒（Sugarcane mosaic virus,SCMV）分离物,命名为SCMV-NCH。根据SCMV外壳蛋白（CP）基因N-端和C-端保守序列设计引物,对SCMV-NCH的CP基因进行RT-PCR扩增、克隆和测序,获得924个核苷酸（nt）,推断编码308个氨基酸（aa）的近全长CP基因序列。与SCMV亚组SCMV、高粱花叶病毒（SrMV）、玉米矮花叶病毒（MDMV）、约翰逊草花叶病毒（JGMV）、玉米花叶病毒（ZeMV）、白草花叶病毒（PenMV）等6种病毒代表性株系外壳蛋白氨基酸序列同源性比较结果显示,SCMV-NCH与SCMV的同源性最高（86.2%）,与其他5种病毒同源性相对较低（56.4%～72.2%）。与SCMV13个分离物外壳蛋白氨基酸序列进行同源性比较并构建关系树,结果显示SCMV-NCH与我国浙江2个分离物（Yuhang和Xiaosh）具有最近的亲缘发生关系。

主 题 词：甘蔗花叶病毒 外壳蛋白基因 序列测定 亲缘关系分析 

学科分类：09[农学] 0904[农学-动物医学类] 090401[090401] 0901[农学-植物生产类] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1000-2286.2008.03.016

馆 藏 号：203224916...