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河北省鼠携带汉坦病毒G2片段基因分型及序列特征分析

河北省鼠携带汉坦病毒G2片段基因分型及序列特征分析

作     者:黄晓霞 李琦 韩占英 张艳波 魏亚梅 许永刚 HUANG Xiao-xia;LI Qi;HAN Zhan-ying;ZHANG Yan-bo;WEI Ya-mei;XU Yong-gang

作者机构:河北省疾病预防控制中心石家庄050021 

基  金:基金项目:河北省科技研究与发展计划项目(07276101D-114) 

出 版 物:《中华实验和临床病毒学杂志》 (Chinese Journal of Experimental and Clinical Virology)

年 卷 期:2009年第23卷第3期

页      码:165-167页

摘      要:目的了解河北省肾综合征出血热(HFRS)疫源地宿主动物所携带汉坦病毒的基因型和基因亚型。方法根据76-118株和R22株的保守序列设计型特异性引物,用RT—nestedPCR从IFA筛选的阳性鼠肺中扩增部分M片段,经琼脂糖凝胶电泳进行基因分型,并从中选取部分扩增产物纯化回收后进行核苷酸序列测定,用DNAStar软件包进行基因分析。结果32份经IFA筛选阳性的鼠肺标本经RT-nestedPCR扩增出d18bp特异性目的片段,均为SEO型。10份扩增产物测序结果表明G2片段变异不大,同源性高达98.0%~100%,与R22株和76—118株的同源性分别为93.3%~94.3%和67.7%~69.0%。结论依据G2片段,河北省HFRS疫源地汉坦病毒基因型以SEO型病毒为主,主要为S3亚型,同亚型病毒基因高度同源,遗传物质相对稳定。不同鼠种可携带同亚型汉坦病毒。

主 题 词:汉坦病毒 基因型 逆转录聚合酶链反应 序列分析 

学科分类:1007[医学-药学类] 100705[100705] 1001[医学-基础医学] 100103[100103] 10[医学] 

核心收录:

D O I:10.3760/cma.j.issn.1003-9279.2009.03.002

馆 藏 号:203225441...

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