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一个新的mariner类转座子的鉴定

一个新的mariner类转座子的鉴定

作     者:李秀兰 姜曰水 曲志才 

作者机构:曲阜师范大学生命科学学院曲阜273165 

基  金:国家自然科学基金项目(Nos.30770145 30771314) 山东省自然科学基金项目(No.Z2002D02) 曲阜师范大学科研基金项目(No.XJ0613)资助 

出 版 物:《应用与环境生物学报》 (Chinese Journal of Applied and Environmental Biology)

年 卷 期:2010年第16卷第4期

页      码:541-544页

摘      要:根据mariner类转座子转座酶的保守区设计简并引物,以曲阜灰飞虱的基因组DNA为模板,通过PCR扩增、回收、克隆和测序,得到长为493bp的片段,命名为qfclone493,提交GenBank数据库,获得注册号为EU542024.将qfclone493与19种有代表性的mariner类转座子核苷酸序列进行系统学分析,结果表明qfclone493属于mauritiana亚族,与此亚族已知mariner类转座子的核苷酸序列同源性最高为74%,认为qfclone493是mauritiana亚族的一个新的mariner类转座子,命名为lsmar1.序列分析表明,lsmar1的最大ORF仅编码141个氨基酸,不能表达完整的转座酶;与隶属于同一亚族、且具有完全自主活性的mos1相比,lsmar1所编码的氨基酸序列在核定位信号(Nuclear location signal,NLS)和D,D(34)D关键部位发生突变,因此推测lsmar1可能不具有转座活性.

主 题 词:灰飞虱 mariner类转座子 序列分析 系统学分析 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 07[理学] 071007[071007] 

核心收录:

D O I:10.3724/sp.j.1145.2010.00541

馆 藏 号:203225888...

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