杧果MiCO基因的克隆与表达模式分析

作     者：徐趁 罗聪 余海霞 陈锦文 何新华 王博 方中斌 XU Chen LUO Cong YU Haixia CHEN Jinwen HE Xinhua WANG Bo FANG Zhongbin

作者机构：广西大学农学院.广西大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室南宁530004 

基　　金：国家自然科学基金(31660561) 广西自然科学基金(2013 GXNSFDA019011 2014GXNSFBAII 8102) 国家现代农业产业技术体系广西杧果创新团队栽培功能岗位项目(nycytxgxcxtd-06-02) 

出 版 物：《果树学报》 (Journal of Fruit Science)

年 卷 期：2017年第34卷第4期

页      码：418-426页

摘      要：【目的】克隆杧果(Mangifera indica L.)MiCO基因并探讨其表达模式,为深入研究该基因的功能奠定基础。【方法】根据从杧果转录组测序数据中获得一个MiCO基因全长序列信息,设计基因全长引物,克隆具有不同开花习性的‘四季杧’和‘紫花杧’2个品种的MiCO基因全长序列,对其序列进行生物信息学分析,并利用荧光定量PCR技术对MiCO基因在杧果不同组织以及年周期的表达情况进行分析。【结果】序列分析显示,2个杧果品种的MiCO基因c DNA全长均为1 150 bp,都包含1个966 bp的开放阅读框,编码322个氨基酸,等电点为5.8,‘四季杧’品种的MiCO蛋白分子质量为35.30 ku,‘紫花杧’品种的MiCO蛋白分子质量为35.22 ku;MiCO基因编码的蛋白具有典型的CO同源蛋白结构,包括B-box1、B-box2和CCT结构域;系统进化树表明,杧果MiCO蛋白属于第一类CO蛋白,与拟南芥(Arabidopsis thaliana)At COL4相似性最高而聚类到一起。基因表达分析表明,MiCO基因在杧果不同组织中均表达,但不同组织的表达水平存在差异。年周期表达分析表明,MiCO基因在杧果成花转变期高度表达,而且在来年的5—6月还存在一个小的表达高峰期,但2个品种不同组织中MiCO基因表达存在差异。【结论】克隆获得杧果MiCO基因全长序列,发现2个具有不同开花习性的杧果品种的MiCO基因核苷酸和氨基酸序列高度同源,只存在少许差异。MiCO基因在杧果成花转变期高度表达,说明MiCO基因与杧果成花关系密切。

主 题 词：杧果 克隆 CO基因 表达 

学科分类：09[农学] 0902[农学-自然保护与环境生态类] 090201[090201] 

核心收录：

D　O　I：10.13925/j.cnki.gsxb.20160263

馆 藏 号：203227287...