番茄DEAD-box RNA解旋酶基因SlDEAH1的克隆及表达分析

作     者：张建苓 陈国平 朱明库 涂昀 胡功铃 胡宗利 

作者机构：重庆大学生物工程学院重庆400044 

基　　金：重庆市自然科学基金(CSTC 2011BB1068) 高等学校博士学科点专项科研基金(20100191110031) 中央高校基本科研业务项目(CDJXS11230018) 

出 版 物：《植物研究》 (Bulletin of Botanical Research)

年 卷 期：2014年第34卷第1期

页      码：44-52页

摘      要：DEAD-box RNA解旋酶是一种特殊的RNA分子伴侣,参与了RNA代谢,包括前体RNA剪接、核糖体合成、RNA降解以及基因表达,并对植物的发育和抗性等也具有重要作用。根据已报道的拟南芥DEAD-box蛋白,通过同源比对,在NCBI据库中筛选得到一个DEAD-box RNA解旋酶同源蛋白,命名为SlDEAH1,并根据其基因序列设计特异引物,应用RT-PCR方法从野生型番茄(Solanum lycopersicum)AC++中克隆得到了该基因的全长编码区序列。利用生物学网站、软件及实时荧光定量PCR方法,对其进行生物信息学、表达模式、胁迫及激素处理分析。结果表明:SlDEAH1包括2 073 bp的开放阅读框,编码690个氨基酸残基,其编码蛋白有9个保守结构基序,其所涉及到的ATP结合、ATP水解及RNA结合等功能对于解旋酶活性是至关重要的;表达模式分析表明SlDEAH1基因可能在野生型番茄萼片、叶片发育及果实成熟方面起到重要作用;高温、低温、脱水、伤害、盐胁迫不同程度的诱导了SlDEAH1的表达,但在根中该基因的表达受盐胁迫抑制;ABA、ACC、IAA、GA3、MeJA和ZT均不同程度诱导了SlDEAH1的表达,其中ABA诱导效应最为明显。这些结果为进一步研究SlDEAH1在番茄发育和胁迫响应中的功能奠定了基础。

主 题 词：番茄 DEAD-box RNA解旋酶 SlDEAH1 胁迫 激素 RT-PCR分析 

学科分类：08[工学] 09[农学] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 0902[农学-自然保护与环境生态类] 090102[090102] 090202[090202] 

核心收录：

D　O　I：10.7525/j.issn.1673-5102.2014.01.007

馆 藏 号：203227473...