版纳微型猪近交系RNF4基因克隆、多组织qPCR表达及功能生物信息学分析

作     者：张霞 曾日彬 霍金龙 王配 陈园园 王淑燕 ZHANG Xia ZENG Ribin HUO Jinlong WANG Pei CHEN Yuanyuan WANG Shuyan

作者机构：云南农业大学云南省版纳微型猪近交系重点实验室昆明650201 云南农业大学动物科学技术学院昆明650201 

基　　金：国家自然科学基金项目(31660637 31460580 31660650) 

出 版 物：《东北农业大学学报》 (Journal of Northeast Agricultural University)

年 卷 期：2017年第48卷第3期

页      码：24-30页

摘      要：RNF4基因调节精细胞分化和增殖过程,文章以Gen Bank下载的猪及近缘物种RNF4 mRNA序列为参考序列,设计特异引物扩增版纳微型猪近交系(BMI)RNF4基因。应用qPCR分析15个重要组织mRNA表达谱,并对蛋白质序列作功能生物信息学分析,构建多物种系统进化树。研究获得BMI RNF4 573 bp编码区序列(Gen Bank登录号:KU705638,对应氨基酸登录号:AOC89056),编码190个氨基酸,蛋白质分子质量(Mw)为21.43 ku,等电点(pI)为6.95。多组织荧光定量表达分析表明RNF4基因在尿道球腺、睾丸、肝、肺中高水平表达;在其他11个组织中呈中低水平表达。功能生物信息学分析表明RNF4蛋白质存在1个保守结构域,无跨膜结构,无信号肽序列;N末端疏水,C末端疏水;有4类功能活性位点,位于细胞核概率为94.1%。系统进化分析表明,BMI与狗亲缘关系最近。结果为研究RNF4基因在猪精细胞分化和增殖方面作用奠定基础。

主 题 词：RING指环 版纳微型猪近交系 组织表达 生物信息学 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

核心收录：

D　O　I：10.3969/j.issn.1005-9369.2017.03.004

馆 藏 号：203227587...