番鸭CRHBP基因多态性及生物信息学分析

作     者：柳诚刚 陆曼 王旭平 杨胜林 Liu Chenggang;Lu Man;Wang Xuping;Yang Shenglin

作者机构：贵州大学动物科学学院贵阳550025 高原山地动物遗传育种与繁殖省部共建教育部重点实验室贵阳550025 

基　　金：国家自然科学基金(31360566) 贵州省教育厅产学研基地项目(黔教合KY字2013-120号) 贵州省科技厅农业重大专项[黔科合重大专项字(2012)6004号]基金共同资助 

出 版 物：《基因组学与应用生物学》 (Genomics and Applied Biology)

年 卷 期：2017年第36卷第4期

页      码：1492-1497页

摘      要：为研究促肾上腺皮质激素释放激素结合蛋白(corticotropin-releasing hormone binding protein,CRHBP)作为番鸭异常行为研究候选基因的可能性。实验以半番鸭为实验材料,设计9对引物对CRHBP基因内含子和外显子序列进行扩增,其PCR产物经测序后,利用生物信息学软件分析SNPs位点突变前后CRHBP基因及其蛋白结构的变化。结果表明,在扩增的CRHBP基因中筛选出12个SNPs:Exon3-G^(5805)A、Exon3-C^(5906)T、Exon7-A^(10747)G、Intron3-A^(5984)G、Intron3-T^(6019)G、Intron3-C^(6021)T、Intron3-G^(6035)A、Intron3-G^(6036)A、Intron7-C^(10506)T、Intron7-A^(10613)G、Intron8-G^(12097)A和Intron8-G^(12118)A,其中Exon3-G^(5805)A和Exon7-A^(10747)G为同义突变;Exon3-C^(5906)T是错义突变,导致编码的缬氨酸(Val)突变为异亮氨酸(Ile);Intron3-A^(5984)G、Intron3-T^(6019)G、Intron3-C^(6021)T、Intron3-G^(6035)A、Intron3-G^(6036)A、Intron7-C^(10506)T、Intron7-A^(10613)G、Intron8-G^(12097)A和Intron8-G^(12118)A处于内含子区域,不参与氨基酸编码。

主 题 词：番鸭 异常行为 CRHBP SNPs 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 0831[工学-公安技术类] 0711[理学-心理学类] 07[理学] 08[工学] 0905[农学-林学类] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

核心收录：

D　O　I：10.13417/j.gab.036.001492

馆 藏 号：203231027...