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新城疫病毒溶瘤株SH15全基因组序列的测定及分析

新城疫病毒溶瘤株SH15全基因组序列的测定及分析

作     者:段坦然 孟春春 车路平 廖瑛 仇旭升 谭磊 孙英杰 宋翠萍 丁铲 唐兆新 DUAN Tan-ran;MENG Chun-chun;CHE Lu-ping;LIAO Ying;QIU Xu-sheng;TAN Lei;SUN Ying-jie;SONG Cui-ping;DING Chan;TANG Zhao-xin

作者机构:华南农业大学兽医学院广东广州510642 中国农业科学院上海兽医研究所上海200241 

基  金:国家自然科学基金项目(31572585) 

出 版 物:《中国兽医科学》 (Chinese Veterinary Science)

年 卷 期:2017年第47卷第6期

页      码:762-767页

摘      要:以上海某鸡场分离的1株对LoVo细胞及A549细胞具有良好的溶瘤效果且呈时间依赖性的新城疫病毒(Newcastle diseases virus,命名为SH15)为研究对象,依据Gen Bank中Mukteswar毒株,设计了10对引物以用于扩增SH15的片段cDNA,并对阳性克隆进行菌液PCR鉴定以及测序分析。测序分析比对结果确定,SH15株的全基因组长15 186 bp,在GenBank登录号为KY247177,结合生物学试验确定为中等毒力型。与其他毒株序列分析表明:该毒株与JS/9/05/Go、Mukteswar的全基因组同源性为99.8%,属于NDV的ClassⅡ分支中的基因Ⅲ型。推测SH15的溶瘤能力可能与HN蛋白中H203位点变异有关。本研究为了解新发现的溶瘤NDV毒株的生物学特性及全基因序列,以及以NDV为载体进一步开发肿瘤靶向药物奠定了基础。

主 题 词:新城疫病毒 溶瘤 全基因测序 基因Ⅲ型 HN蛋白 

学科分类:090601[090601] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

D O I:10.16656/j.issn.1673-4696.2017.06.015

馆 藏 号:203232061...

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