赤眼鳟线粒体NADH脱氢酶6基因克隆及序列特征分析

作     者：沈莹 左成学 吴敏 王星果 张营 徐建荣 顾志良 

作者机构：常熟理工学院生物系江苏常熟215500 

基　　金：2009江苏省高等学校大学生实践创新训练计划项目 

出 版 物：《安徽农业科学》 (Journal of Anhui Agricultural Sciences)

年 卷 期：2010年第38卷第1期

页      码：85-87页

摘      要：[目的]根据赤眼鳟线粒体NADH脱氢酶6(ND6)基因序列分析不同种鱼类的分子进化关系。[方法]根据其他鱼类的线粒体ND6基因及侧翼序列设计引物,采用PCR扩增并克隆、测序赤眼鳟ND6基因,通过MEGA4.0 Neighbor-Joining法分析不同鱼类的进化关系。[结果]赤眼鳟(Squaliobarbus curriculus)线粒体基因组ND6基因序列长度为522 bp,编码173个氨基酸。该基因碱基组成为:A41.5%、C32.7%、G12.4%、T13.4%,其中A+T含量(54.9%)高于G+C含量(45.1%)。将赤眼鳟ND6基因序列与GenBank中其他11种鱼类ND6基因序列进行比对发现,赤眼鳟ND6核酸序列与团头鲂的同源性最高,为90.8%;与红点鲑鱼的同源性最低,为73.0%。赤眼鳟ND6氨基酸序列与其他物种ND6氨基酸进行比对发现,赤眼鳟与团头鲂同源性最高,为98.3%;与大黄鱼的同源性最低,为75.7%。以ND6氨基酸序列采用NJ法构建12种鱼类的系统发生树基本反映了它们的种间、属间和科间的关系。[结论]首次得到了赤眼鳟线粒体ND6基因序列,并确定了赤眼鳟与其他11种鱼类的分子进化关系。

主 题 词：赤眼鳟 ND6基因 DNA序列 系统进化 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 071008[071008] 

D　O　I：10.3969/j.issn.0517-6611.2010.01.032

馆 藏 号：203232254...