日本蛇根草查尔酮异构酶基因的克隆及其生物信息学分析

作     者：孙威 刘杰 陈婷 汤晓辛 鞠志刚 乙引 Sun Wei;Liu Jie;Chen Ting;Tang Xiaoxin;Ju Zhigang;Yi Yin

作者机构：贵州师范大学生命科学学院植物生理与发育调控重点实验室贵阳550025 贵阳中医学院药学院贵阳550025 

基　　金：贵州师范大学资助博士科研项目(0516006) 贵州省联合基金项目(黔科合LH字7777号) 贵州省重点实验室建设项目(黔科合计Z字4005)共同资助 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2017年第15卷第5期

页      码：1648-1654页

摘      要：查尔酮异构酶(CHI)是类黄酮生物合成过程中的关键酶之一,其在类黄酮的合成过程中发挥着非常重要的作用。本研究以日本蛇根草为研究材料,根据其转录组测序结果设计全长引物,通过RT-PCR方法成功克隆得到日本蛇根草查尔酮异构酶基因完整的cDNA序列,并对其进行生物信息学分析。结果表明,该基因序列全长为702 bp,编码233个氨基酸,预测其蛋白分子量为25.018 k D,等电点为4.95,是亲水性蛋白质,不含有信号肽,很可能定位在叶绿体基质中。同时,二级结构分析显示,日本蛇根草CHI的二级结构分别由96个α螺旋、51个延伸链、86个无规则卷曲组成,这与三维结构预测结果相一致。日本蛇根草CHI基因的克隆对于研究植物类黄酮的生物合成及其分子机制具有重要意义,同时也丰富了双子叶植物CHI基因家族的相关研究。

主 题 词：日本蛇根草 CHI 基因克隆 生物信息学分析 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 090102[090102] 

核心收录：

D　O　I：10.13271/j.mpb.015.001648

馆 藏 号：203232361...