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主要麻类作物的ITS序列分析与系统进化

主要麻类作物的ITS序列分析与系统进化

作     者:张力岚 王俊 万雪贝 徐益 张列梅 方平平 祁建民 张立武 ZHANG Li-Lan;WANG Jun;WAN Xue-Bei;XU Yi;ZHANG Lie-Mei;FANG Ping-Ping;QI Jian-Min;ZHANG Li-Wu

作者机构:福建农林大学作物科学学院/作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室/福建省作物设计育种重点实验室 福建农林大学海峡联合研究院基因组与生物技术中心福建福州350002 

基  金:高等学校博士学科点专项科研基金新教师类资助项目(20133515120002) 中贝粮油及特色经济作物引育种及新品种示范推广项目(2015I0001) 福建农林大学杰出青年科研基金项目(2012xjj01 xjq201401) 福建农林大学大学生创新训练计划项目(201610389149)资助 国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-19-E6) 农业部东南黄红麻实验观测站项目(农科教发2011)~~ 

出 版 物:《作物学报》 (Acta Agronomica Sinica)

年 卷 期:2017年第43卷第6期

页      码:862-874页

摘      要:比较主要麻类作物和测序植物间的ITS序列,可明确它们间系统位置和进化关系。本研究采用PCR扩增和搜索Gen Bank数据库,获得32份麻类作物和11份测序作物的核糖体内转录间隔区(internal transcribed spacers,ITS)序列,利用MEGE软件分析ITS长度、G+C含量与同源性百分比差异。结果表明,黄麻属、红麻属、苎麻属和亚麻属的ITS基本序列全长分别为963、939、658和686 bp;G+C含量分别为57.87%、58.03%、59.05%和53.75%。黄麻属变异区域集中在220~386 bp间,红麻属变异区域集中在2个区段(206~347 bp,599~713 bp),苎麻属ITS变异区域分布在4个区段(158~163 bp、193~199 bp、288~333 bp和681~688 bp),亚麻属ITS变异区域分布在5个区段(219~229bp、235~240 bp、427~432 bp、468~484 bp和588~594 bp)。系统位置分析表明,红麻属与棉花亲缘关系最近,黄麻与棉花亲缘关系较近;亚麻与苎麻各为一小支。系统位置分析与传统的植物分类结果较一致。研究主要麻类作物比较基因组学时,红麻、黄麻可参考棉花,苎麻可参考杨树或蓖麻。推测红麻属的进化时间约为33.7百万年前(million years ago,MYA),黄麻属约为65.3MYA,苎麻属约为67.5MYA,亚麻属约为90.5MYA。主要麻类作物进化时间越久,同属不同种之间ITS变异区段越多。

主 题 词:麻类作物 ITS 系统位置 进化关系 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 0831[工学-公安技术类] 07[理学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 0902[农学-自然保护与环境生态类] 090102[090102] 

核心收录:

D O I:10.3724/SP.J.1006.2017.00862

馆 藏 号:203232386...

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