犬瘟热病毒AH株全基因组序列测定及其分子特征

作     者：刘柱 李丹丹 李琦 宫晓华 缪秋红 李传峰 陈宗艳 张淼涛 刘光清 LIU Zhu;LI Dan-dan;LI Qi;GONG Xiao-hua;MIAO Qiu-hong;LI Chuan-feng;CHEN Zong-yan;ZHANG Miao-tao;LIU Guang-qing

作者机构：中国农业科学院上海兽医研究所上海200241 西北农林科技大学动物医学院杨凌712100 甘肃农业大学动物医学院兰州730070 安徽农业大学动物科技学院合肥230036 

基　　金：国家自然科学基金项目(31270194 31502068) 上海市科技兴农重点攻关项目(2016043) 上海市科委创新项目(13391901602) 公益性农业科研专项(201303046) 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(2016JB01 31101848) 

出 版 物：《中国动物传染病学报》 (Chinese Journal of Animal Infectious Diseases)

年 卷 期：2017年第25卷第2期

页      码：1-8页

摘      要：本研究对犬瘟热病毒(Canine distemper virus,CDV)安徽分离株(CDV-AH株)的全基因组序列进行了测定和分析。根据GenBank上已发表的部分CDV基因组全长序列设计了8对特异性引物,RT-PCR方法分段扩增出CDV-AH株的全基因组序列。采用DNAStar软件和MEGA软件对CDV-AH株与其他CDV毒株的基因序列进行了比对和分析,并绘制系统进化树。结果显示,CDV-AH株全长15 690 bp,编码6种结构蛋白(N、P、M、F、H和L),与CDV-PS株核苷酸序列同源性最高,为98.8%,而与CDV-1以及Onderstepoort等疫苗株的序列同源性较低,为92.1%。CDV-AH株在保守区域出现15处氨基酸突变,这些突变对其所编码蛋白结构和功能的影响需要进一步研究。基于H基因序列的系统进化分析表明,CDV-AH株与其他CDV野毒株共同形成一个拓扑群,属于亚洲Ⅰ型。

主 题 词：犬瘟热病毒 全基因组 序列分析 

学科分类：090601[090601] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

馆 藏 号：203232589...