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基于恒温隔绝式荧光PCR技术现场检测牛轮状病毒方法的建立及应用

基于恒温隔绝式荧光PCR技术现场检测牛轮状病毒方法的建立及应用

作     者:李凡 岳华 邱莞思 张斌 黄建德 汤承 

作者机构:西南民族大学生命科学与技术学院成都610041 国家民委青藏高原动物疫病防控创新团队成都610041 金瑞鸿捷(厦门)生物科技有限公司厦门361000 

基  金:十三五国家重点研发计划(2016YFD0500907) 国家民委科研项目(14XNZ025) 

出 版 物:《畜牧兽医学报》 (ACTA VETERINARIA ET ZOOTECHNICA SINICA)

年 卷 期:2017年第48卷第6期

页      码:1092-1098页

摘      要:轮状病毒(rotavirus,RV)是犊牛腹泻的重要病因,笔者旨在建立基于恒温隔绝PCR(insulated isothermal PCR,iiPCR)技术现场检测牛轮状病毒(bovine rotavirus,BRV)的方法。根据BRV和牦牛RVVP6基因序列,设计合成引物和探针,通过优化反应体系,配合商品化PetNAD核酸萃取试剂盒,建立了检测BRV和牦牛RV的iiPCR方法。结果显示该方法只能检出BRV和牦牛RV,不能检出牛冠状病毒、牛星状病毒、牛病毒性腹泻-黏膜病病毒、牛大肠杆菌、牛沙门菌、牛艾美尔球虫、牛瑞氏隐孢子虫等无关病原;检测下限为96.6copies·μL-1,重复性好;对30份牛腹泻样本和30份牦牛腹泻样本的检测结果表明,本方法对BRV的检出率是33.33%,对牦牛RV的检出率为73.33%,与文献报道的检测BRV和牦牛RV的方法的符合率分别为100%;对2016年四川阿坝藏羌自治州14个牧场的88份犊牦牛腹泻样本RV的检测结果显示RV核酸阳性检出率为98.86%。本研究建立的BRV iiPCR方法特异性好、灵敏度高、重复性好,既可用于BRV检测,又可用于牦牛RV的检测;从核酸提取到报告检测结果仅需1h,操作方便,可现场使用,为BRV的现场快速诊断提供有力的工具。

主 题 词: 牦牛 轮状病毒 VP6基因 恒温隔绝PCR 现场检测 

学科分类:090601[090601] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

核心收录:

D O I:10.11843/j.issn.0366-6964.2017.06.014

馆 藏 号:203233878...

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