人类丝氨酸消旋酶的同源模建及其与多肽类抑制剂的分子对接

作     者：赵勇山 郑清川 张红星 楚慧郢 孙家钟 ZHAO Yong-Shan;ZHENG Qing-Chuan;ZHANG Hong-Xing;CHU Hui-Ying;SUN Chia-Chung

作者机构：吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室长春130023 

基　　金：国家自然科学基金(20573042) 国家科技支撑计划重点项目(2006BAE03B01) 高等学校博士点学科专项基金(20070183046)资助 

出 版 物：《物理化学学报》 (Acta Physico-Chimica Sinica)

年 卷 期：2009年第25卷第3期

页      码：417-422页

摘      要：利用同源模建和分子动力学模拟方法构建了人类丝氨酸消旋酶(hSR)的三维结构,并利用profile-3D和procheck方法评估了模型的可靠性.在此基础上用分子对接程序(affinity)将多肽类抑制剂A和B分别与hSR进行对接,获得了其复合物结构的理论模型.通过配体与受体之间相互作用能和结构分析给出了此类抑制剂与hSR的具体结合方式,明确了hSR与此类抑制剂结合时起重要作用的氨基酸残基,为基于人类丝氨酸消旋酶三维结构的药物设计提供重要的参考信息.

主 题 词：人类丝氨酸消旋酶 分子动力学模拟 分子对接 同源模建 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 071010[071010] 081704[081704] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-轻工类] 0703[理学-化学类] 0702[理学-物理学类] 

核心收录：

D　O　I：10.3866/PKU.WHXB20090304

馆 藏 号：203234378...