浙江省茶树地方品种与选育品种遗传多样性和群体结构的EST-SSR分析

作     者：乔婷婷 马春雷 周炎花 姚明哲 刘饶 陈亮 QIAO Ting-Ting;MA Chun-Lei;ZHOU Yan-Hua;YAO Ming-Zhe;LIU Rao;CHEN Liang

作者机构：中国农业科学院茶叶研究所茶树资源与改良研究中心/国家茶树改良中心浙江杭州310008 

基　　金：国家高技术研究发展计划(863计划)项目(2006AA10Z171) 国家农业(茶叶)产业技术体系建设专项 国家自然科学基金项目(30901159) 国家公益性行业(农业)科研专项(3-35) 浙江省科技计划项目(2006C12129)资助 

出 版 物：《作物学报》 (Acta Agronomica Sinica)

年 卷 期：2010年第36卷第5期

页      码：744-753页

摘      要：以茶树品种龙井43幼根为材料,构建cDNA文库并测序,获得4833条EST序列,拼接后得到3482条无冗余EST,总长2290kb。对其进行SSR搜索,共检测到577个SSR位点,分布于500条茶树幼根EST中,其中含有EST-SSR的序列占14.36%,平均每3.97kb出现一个SSR。利用Primer premier5.0,对含有SSR的EST设计引物416对,通过退火温度和多态性筛选,确定可用的引物及其最佳退火温度,并从筛到的引物中选取63对及1对已发表引物作为核心引物,对浙江省茶树地方品种和选育品种进行遗传多样性和遗传结构分析。结果显示,64对引物均在供试材料中表现出多态性,共检测到232个等位位点,平均每对引物3.6个;每对引物可鉴定的基因型为2～13个,平均4.3个。供试材料多态性信息量(PIC)介于0.02～0.84,平均0.44;扩增位点的观测杂合度平均为0.44,期望杂合度平均为0.48。地方品种的遗传多样性水平略高于选育品种(系)。不同地方资源群体多态性信息量为0.24～0.36,举岩群体的多样性最高,惠明群体的多样性最低。浙江各地区以杭州资源的多态性最高,PIC达0.41;丽水的多态性最低,PIC为0.24。Structure2.2群体结构分析和UPGMA聚类分析表明,地方品种、选育品种(系)具有相对独立的群体结构,选育品种(系)根据亲缘关系的不同形成不同的类群。

主 题 词：茶树 遗传多样性 遗传结构 EST-SSR 

学科分类：09[农学] 090203[090203] 0902[农学-自然保护与环境生态类] 

核心收录：

D　O　I：10.3724/SP.J.1006.2010.00744

馆 藏 号：203234444...