TMT标记联合LC—MS／MS技术在分析非功能垂体腺瘤蛋白质组的重复性研究

作     者：慕云 龙樱 杨海燕 黄育达 詹显全 李学军 Mu Yun Long Ying Yang Haiyan Huang Yuda Li Xnejun Zhan Xianquan

作者机构：中南大学湘雅医院卫生部肿瘤蛋白质组学重点实验室、结构生物学与药物设计湖南省工程实验室、抗癌药物国家地方联合工程实验室长沙410008 中南大学湘雅医院神经外科长沙410008 

基　　金：国家高技术“863计划”子项目(2014AA020610-1) 湘雅医院人才引进基金(詹显全) 国家自然科学基金(81272798 81572278) 湖南省自然科学基金(14JJ7008) 

出 版 物：《中国医师杂志》 (Journal of Chinese Physician)

年 卷 期：2017年第19卷第6期

页      码：827-832页

摘      要：目的探索TMT标记联合LC-MS／MS技术在分析非功能垂体腺瘤蛋白质组的重复性以获得FSH＋和FSH-非功能垂体腺瘤间的可靠差异表达蛋白质。方法将两组样品抽提蛋白质、SDS—PAGE、胰酶酶解后，用6-plexTMT对两组样品肽段分别进行三次平行重复实验，然后用色谱柱对样品进行分离成80个组分合并至18份，LC—MS／MS分析，运用Mascot搜索引擎（v．2．3．0）对串联质谱数据进行搜库。结果SDS—PAGE电泳条带正常区分度较高，并且清晰可分辨，保证了本次实验的蛋白质样品质量。质谱数据校验表明鉴定的6076个蛋白质及其中的4666定量蛋白质的肽段长度符合胰酶酶解消化肽段的规律。对于两组样品分别进行三次TMT标记实验结果的重复性分析发现：FSH＋和FSH一组99％以上定量蛋白质的平均变异系数〈20％，约100％的定量蛋白质平均变化倍数〈1．6倍，两组组内相关系数均位于0．9～1，这说明TMT定量蛋白质组学在对每组样品分析均具有高的重复性。结论TMT标记联合LC—MS／MS技术是一高通量和高重复性的有效定量蛋白质组学技术。

主 题 词：串联质谱法 色谱法 液相 垂体肿瘤/代谢 蛋白质组 

学科分类：1002[医学-临床医学类] 100214[100214] 10[医学] 

D　O　I：10.3760/cma.j.issn.1008-1372.2017.06.009

馆 藏 号：203237130...