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兔出血症病毒(RHDV)全基因组克隆与分子流行病学分析

兔出血症病毒(RHDV)全基因组克隆与分子流行病学分析

作     者:向华 宣华 隋慧 王贵平 王文成 李尚波 卫广森 XIANG Hua;XUAN Hua;SUI Hui;WANG Gui-ping;WANG Wen-cheng;LI Shang-bo;WEI Guang-shen

作者机构:广东省农业科学院兽医研究所广东广州510640 军需大学军事兽医系吉林长春130062 辽宁省益康生物制品厂辽宁辽阳111000 

基  金:吉林省科委资助项目(20030557) 

出 版 物:《中国预防兽医学报》 (Chinese Journal of Preventive Veterinary Medicine)

年 卷 期:2006年第28卷第5期

页      码:592-595页

摘      要:根据GenBank已发表的多株RHDV全基因组序列,设计3对扩增RHDVCD株的特异性引物,扩增了RHDVCD株包含全序列的3个片段,并分别克隆到pMD18-T载体上。根据引物上唯一的交叉酶切位点,把三个克隆片段同时克隆到pUC18载体上,获得了RHDVCD株全基因组克隆,测定了全基因组序列(GenBankaccessionnumberAY523410)。进行了CD株全序列与GenBank上已发布的其他6株全序列比较及基因进化树分析。发现除CD株外,其余6株(西班牙AST-89株、法国SD株、意大利BS89株、德国分离1株、德国分离2株、澳大利亚CzechV351株)之间的同源性均很高,在93.9%~100%之间,而CD株与其他6株之间的同源性均较低,在89.0%~89.6%之间。德国的2个分离株序列完全相同,应为同一毒株。进化树分析表明,此7株病毒可形成2个明显的分支,中国CD株形成一个分支,其余欧洲、澳大利亚分离株开成一个分支,具有明显地域差异特征。

主 题 词:兔出血症病毒 基因组 序列分析 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 090601[090601] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 0906[农学-水产类] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

核心收录:

D O I:10.3969/j.issn.1008-0589.2006.05.026

馆 藏 号:203239746...

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