陆地棉水通道蛋白GhNIP6.1基因的克隆及表达分析

作     者：巩元勇 郭书巧 束红梅 倪万潮 GONG Yuan-yong;GUO Shu-qiao;SHU Hong-mei;NI Wan-chao

作者机构：江苏省农业科学院经济作物研究所/农业部长江下游棉花和油菜重点实验室江苏南京210014 

基　　金：国家转基因重大专项(2011ZX08005-001) 国家自然科学基金(31101452) 江苏省农业科学院博士后科研资助计划(012066511108) 江苏省自然科学基金(BK2010465) 

出 版 物：《棉花学报》 (Cotton Science)

年 卷 期：2013年第25卷第1期

页      码：1-8页

摘      要：根据EST拼接的序列设计引物,利用RT-PCR技术,从陆地棉品种苏棉18中克隆获得了一个水通道蛋白基因GhNIP6.1。该基因开放阅读框包含903个核苷酸,编码300个氨基酸,分子量为30.97kD,理论等电点为8.99。GhNIP6.1蛋白的生物信息学分析表明:GhNIP6.1含有6个跨膜区,由5个环相连,其中环A、C和E在细胞膜外,环B、D和蛋白的N、C末端都位于细胞膜内,N末端79个氨基酸,C末端18个氨基酸,具有MIP家族典型的保守氨基酸序列;该蛋白的三级结构同拟南芥的AtNIP6.1非常相似,亚细胞定位也同AtNIP6.1一致,可能位于质膜中。进化分析发现,GhNIP6.1蛋白同拟南芥的AtNIP6.1蛋白相似性最高。进一步扩增棉花核基因组获得了2021bp的DNA序列,它包含5个外显子和4个内含子,所有外显子/内含子交接点都遵从gt/ag剪接规则。半定量分析表明,该基因在根、茎和叶中都有表达,其中真叶含量较高,子叶中没有表达。

主 题 词：陆地棉 水通道蛋白 GhNIP6.1 表达序列标签 

学科分类：09[农学] 0901[农学-植物生产类] 

核心收录：

D　O　I：10.3969/j.issn.1002-7807.2013.01.001

馆 藏 号：203242389...