鲢InDel-RFLP标记开发及其在连锁图谱构建中的应用

作     者：张鹏 杨官品 张立楠 危起伟 邹桂伟 ZHANG Peng;YANG Guan-pin;ZHANG Li-nan;WEI Qi-wei;ZOU Gui-wei

作者机构：中国海洋大学海洋生物遗传育种教育部重点实验室山东青岛266003 中国水产科学研究院长江水产研究所武汉430223 

基　　金：农业部淡水鱼类种质资源与生物技术重点开放实验室开放课题(LFB20070601) 现代农产品加工技术研发体系专项基金(nycytx-49-01) 

出 版 物：《淡水渔业》 (Freshwater Fisheries)

年 卷 期：2011年第41卷第2期

页      码：43-50,29页

摘      要：基于随机测序的鲢(Hypophthalmichthys molitrix)基因组片段,尝试开发基于InDel的限制性片段长度多态性标记(InDel-RFLP)。结果显示:共133个片段中,65个在一个野生鲢群体(该野生鲢群体采自长江流域荆州段,31个个体)中表现多态性。共检测到163个等位基因,每位点等位基因数从2到4不等,平均2.5个。65个多态性标记中,有35个被添加到鲢SSR-AFLP性别平均连锁图谱上。长约2 kb的片段比长约1 kb的片段更适用于InDel-RFLP标记开发。设计特异引物,扩增基因组片段,用4种限制性内切酶(BsuR I、Hha I、Taq I和Vsp I)之一切成适宜聚丙烯酰胺凝胶电泳分离的小片段,电泳分离、银染分型。该标记系统避免了对InDel精确定位的困难,通过高分辨PAGE分型,可为鲢连锁图谱构建和性状定位提供丰富的标记位点。

主 题 词：鲢(Hypophthalmichthys molitrix) 碱基插入缺失 限制性片段长度多态性 连锁图谱 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 090102[090102] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1000-6907.2011.02.007

馆 藏 号：203247899...