草莓EST-SSR标记的开发与应用

作     者：王静 赵密珍 于红梅 王壮伟 

作者机构：江苏省农业科学院园艺研究所南京210014 

基　　金：农业部行业计划(201003064) 江苏省科技基础设施建设计划(BM2008008) 

出 版 物：《果树学报》 (Journal of Fruit Science)

年 卷 期：2011年第28卷第4期

页      码：721-726页

摘      要：从公共数据库中下载61 731条草莓表达序列标签(Expressed Sequence Tag,EST),组装后得到系列非冗余EST 14 948条,总长度为9 969.35 kb,挖掘到1 807个SSR,分布在1 515条序列上,发生频率为10.14%,平均每5.52kb出现1个SSR(Simple Sequence Repeat)。其中,235条系列包含2个或2个以上SSR,76个SSR以复合形式出现。二核苷酸(794个SSR)和三核苷酸(795个SSR)是主要的类型,所占比例分别为43.94%和44.00%。AG/CT(691个)和AAG/CTT(278个)在二、三核苷酸中占主导地位。利用这些序列,设计47对引物,对生产上主栽的3个日本品种进行多态性研究,44对引物有扩增产物,6对表现多态性。结果表明,从草莓相关EST数据库中开发的EST-SSR引物可行且有用,在草莓品种鉴定、种质资源分析、遗传作图等研究方面有广阔的应用前景。

主 题 词：草莓 EST-SSR 标记开发 

学科分类：09[农学] 0902[农学-自然保护与环境生态类] 090201[090201] 

D　O　I：10.13925/j.cnki.gsxb.2011.04.035

馆 藏 号：203248166...