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杜氏盐藻光系统Ⅱ反应中心蛋白D1基因的克隆及序列分析

杜氏盐藻光系统Ⅱ反应中心蛋白D1基因的克隆及序列分析

作     者:刘红涛 范天黎 鲁照明 王鹏举 陈涛 薛乐勋 LIU Hongtao;FAN Tianli;LU Zhaoming;WANG Pengju;CHEN Tao;XUE Lexun

作者机构:郑州大学生物工程系细胞生物学研究室郑州450052 郑州大学基础医学院药理学教研室郑州450051 

基  金:国家自然科学基金资助项目30600006 

出 版 物:《郑州大学学报(医学版)》 (Journal of Zhengzhou University(Medical Sciences))

年 卷 期:2008年第43卷第6期

页      码:1123-1126页

摘      要:目的:克隆杜氏盐藻光系统Ⅱ反应中心蛋白D1(psbA)基因cDNA片段。方法:根据莱茵衣藻、稻以及普通小球藻等真核生物psbA基因的氨基酸高度保守序列,设计一对简并引物,利用Trizol试剂提取杜氏盐藻细胞总RNA,通过RT-PCR获得杜氏盐藻psbA cDNA,PCR产物连接T载体转化大肠杆菌JM109,随机挑取数个菌落,筛选鉴定并测序,测序结果进行Blast比对分析和密码子偏爱性分析。结果:获得的cDNA片段长度为999 bp,编码333个氨基酸。其氨基酸序列与其他物种进行Blast比对,同源性分别为:衣藻89%、椭圆小球藻89%、莱茵衣藻89%、普通小球藻88%和玉米87%。psbA基因存在明显的密码子偏爱性,其(A+T)含量明显高于(G+C)含量。另外,所克隆的psbA序列编码赖氨酸残基的数量为1个。结论:所克隆的序列为杜氏盐藻psbA基因cDNA片段。

主 题 词:杜氏盐藻 光系统Ⅱ反应中心蛋白D1基因 简并引物 密码子偏爱性 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

D O I:10.3969/j.issn.1671-6825.2008.06.015

馆 藏 号:203248394...

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