东方肉座菌EU7-22木聚糖酶和木糖苷酶基因克隆及生物信息学研究

作     者：龙传南 蒋凤姣 邬小兵 刘健 龙敏南 LONG Chuan-nan;JIANG Feng-jiao;WU Xiao-bing;LIU Jian;LONG Min-nan

作者机构：厦门大学能源研究院福建厦门361005 厦门大学生命科学学院福建厦门361005 

基　　金：国家重点基础研究发展计划(973计划)(NO.2010CB732201) 中央高校基本科研业务费专项资金(NO.201112G026) 国家自然科学基金(NO.31170067) 

出 版 物：《生物信息学》 (Chinese Journal of Bioinformatics)

年 卷 期：2013年第11卷第1期

页      码：58-64页

摘      要：东方肉座菌EU7-22具有高产半纤维素酶的能力。根据已报道的同属里氏木霉及绿色木霉木聚糖酶,木糖苷酶相关基因序列,设计PCR引物扩增出东方肉座菌内切木聚糖酶(XYNⅠ,XYNⅡ)及β-木糖苷酶(β-BXL)基因。序列经NCBIBlast分析:东方肉座菌xynⅠ基因与里氏木霉xyn1基因(X69573.1)的同源性最高达到91%;xynⅡ基因与绿色木霉xyn2基因(EF079061)同源性最高达到93%;β-bxl基因与里氏木霉β-bxl1基因(Z69257.1)的同源性最高达到94%。生物信息学分析表明内切木聚糖酶Ⅰ和Ⅱ均属于糖基水解酶家族11,N末端前19个氨基酸均为信号肽。内切木聚糖酶Ⅰ分子量为24.13kD,等电点为7.87,含有3个糖基化位点;内切木聚糖酶Ⅱ分子量为24.44kD,等电点为4.86,含有1个糖基化位点;β-木糖苷酶属于糖基水解酶家族3,分子量为87.27kD,等电点为5.49,N末端前20个氨基酸为信号肽,含有8个糖基化位点。利用SWISS-Model对木聚糖酶,木糖苷酶蛋白质三级结构进行了预测和模拟。对木聚糖酶和木糖苷酶基因及其编码蛋白质的生物信息学分析,为进一步研究这些基因的表达与调控、构建高效利用纤维素组份的工程菌株奠定基础。

主 题 词：东方肉座菌 木聚糖酶 木糖苷酶 基因克隆 生物信息学 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 090102[090102] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1672-5565.2013.01.10

馆 藏 号：203250008...